Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
DSG1Q02413 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
DSG1Q02413 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
DSG1Q02413 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
DSG1Q02413 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
DSG1Q02413 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
DSG1Q02413 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
DSG1Q02413 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
DSG1Q02413 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
DSG1Q02413 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
DSG1Q02413 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
DSG1Q02413 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DSG1Q02413 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DSG1Q02413 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DSG1Q02413 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DSG1Q02413 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
DSG1Q02413 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DSG1Q02413 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
DSG1Q02413 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DSG1Q02413 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
DSG1Q02413 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DSG1Q02413 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DSG1Q02413 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DSG1Q02413 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DSG1Q02413 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DSG1Q02413 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DSG1Q02413 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DSG1Q02413 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DSG1Q02413 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DSG1Q02413 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DSG1Q02413 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DSG1Q02413 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DSG1Q02413 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DSG1Q02413 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DSG1Q02413 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DSG1Q02413 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DSG1Q02413 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DSG1Q02413 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DSG1Q02413 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DSG1Q02413 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DSG1Q02413 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DSG1Q02413 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DSG1Q02413 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DSG1Q02413 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
DSG1Q02413 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
DSG1Q02413 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DSG1Q02413 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
DSG1Q02413 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DSG1Q02413 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DSG1Q02413 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DSG1Q02413 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DSG1Q02413 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DSG1Q02413 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DSG1Q02413 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DSG1Q02413 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DSG1Q02413 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DSG1Q02413 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DSG1Q02413 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DSG1Q02413 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DSG1Q02413 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DSG1Q02413 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DSG1Q02413 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DSG1Q02413 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DSG1Q02413 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DSG1Q02413 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DSG1Q02413 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DSG1Q02413 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DSG1Q02413 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DSG1Q02413 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DSG1Q02413 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DSG1Q02413 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DSG1Q02413 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DSG1Q02413 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DSG1Q02413 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DSG1Q02413 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DSG1Q02413 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DSG1Q02413 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
DSG1Q02413 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DSG1Q02413 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DSG1Q02413 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DSG1Q02413 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DSG1Q02413 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DSG1Q02413 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DSG1Q02413 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DSG1Q02413 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DSG1Q02413 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DSG1Q02413 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DSG1Q02413 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DSG1Q02413 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DSG1Q02413 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DSG1Q02413 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DSG1Q02413 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DSG1Q02413 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DSG1Q02413 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DSG1Q02413 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DSG1Q02413 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DSG1Q02413 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
DSG1Q02413 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DSG1Q02413 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
DSG1Q02413 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms