Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HBBP68871 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
HBBP68871 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HBBP68871 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HBBP68871 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HBBP68871 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HBBP68871 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HBBP68871 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HBBP68871 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HBBP68871 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HBBP68871 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HBBP68871 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HBBP68871 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HBBP68871 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HBBP68871 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HBBP68871 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HBBP68871 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HBBP68871 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HBBP68871 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HBBP68871 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HBBP68871 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HBBP68871 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HBBP68871 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HBBP68871 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HBBP68871 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HBBP68871 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HBBP68871 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HBBP68871 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HBBP68871 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HBBP68871 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HBBP68871 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HBBP68871 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HBBP68871 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HBBP68871 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HBBP68871 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HBBP68871 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HBBP68871 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HBBP68871 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HBBP68871 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HBBP68871 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HBBP68871 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HBBP68871 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HBBP68871 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HBBP68871 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HBBP68871 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HBBP68871 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HBBP68871 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HBBP68871 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HBBP68871 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HBBP68871 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HBBP68871 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HBBP68871 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HBBP68871 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HBBP68871 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HBBP68871 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HBBP68871 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HBBP68871 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HBBP68871 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HBBP68871 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HBBP68871 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HBBP68871 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HBBP68871 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HBBP68871 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HBBP68871 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HBBP68871 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HBBP68871 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HBBP68871 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HBBP68871 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HBBP68871 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HBBP68871 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HBBP68871 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HBBP68871 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HBBP68871 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HBBP68871 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HBBP68871 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HBBP68871 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HBBP68871 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HBBP68871 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HBBP68871 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HBBP68871 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HBBP68871 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HBBP68871 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HBBP68871 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HBBP68871 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HBBP68871 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HBBP68871 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HBBP68871 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HBBP68871 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HBBP68871 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HBBP68871 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HBBP68871 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HBBP68871 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HBBP68871 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HBBP68871 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HBBP68871 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HBBP68871 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HBBP68871 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HBBP68871 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HBBP68871 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HBBP68871 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms