Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms