Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVK-21P61565 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms