Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms