Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTPAP49638 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTPAP49638 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTPAP49638 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTPAP49638 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTPAP49638 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTPAP49638 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTPAP49638 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTPAP49638 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTPAP49638 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTPAP49638 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTPAP49638 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTPAP49638 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTPAP49638 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTPAP49638 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TTPAP49638 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTPAP49638 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTPAP49638 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTPAP49638 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTPAP49638 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTPAP49638 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTPAP49638 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTPAP49638 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTPAP49638 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTPAP49638 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTPAP49638 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTPAP49638 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTPAP49638 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTPAP49638 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TTPAP49638 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTPAP49638 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTPAP49638 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTPAP49638 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTPAP49638 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTPAP49638 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTPAP49638 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTPAP49638 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTPAP49638 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TTPAP49638 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTPAP49638 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTPAP49638 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTPAP49638 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTPAP49638 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTPAP49638 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTPAP49638 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTPAP49638 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTPAP49638 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTPAP49638 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTPAP49638 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTPAP49638 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTPAP49638 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTPAP49638 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTPAP49638 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTPAP49638 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTPAP49638 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTPAP49638 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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TTPAP49638 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTPAP49638 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTPAP49638 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTPAP49638 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTPAP49638 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TTPAP49638 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTPAP49638 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTPAP49638 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTPAP49638 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTPAP49638 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTPAP49638 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTPAP49638 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTPAP49638 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTPAP49638 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTPAP49638 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTPAP49638 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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TTPAP49638 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTPAP49638 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTPAP49638 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTPAP49638 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTPAP49638 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TTPAP49638 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTPAP49638 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTPAP49638 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTPAP49638 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTPAP49638 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTPAP49638 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTPAP49638 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTPAP49638 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTPAP49638 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTPAP49638 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTPAP49638 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTPAP49638 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTPAP49638 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTPAP49638 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTPAP49638 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTPAP49638 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTPAP49638 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTPAP49638 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTPAP49638 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTPAP49638 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTPAP49638 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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