Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCAMP43121 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCAMP43121 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCAMP43121 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCAMP43121 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCAMP43121 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCAMP43121 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCAMP43121 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCAMP43121 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCAMP43121 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCAMP43121 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MCAMP43121 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCAMP43121 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCAMP43121 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCAMP43121 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MCAMP43121 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCAMP43121 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCAMP43121 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCAMP43121 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCAMP43121 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCAMP43121 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCAMP43121 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCAMP43121 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCAMP43121 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCAMP43121 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCAMP43121 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCAMP43121 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCAMP43121 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCAMP43121 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCAMP43121 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCAMP43121 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MCAMP43121 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MCAMP43121 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCAMP43121 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCAMP43121 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MCAMP43121 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCAMP43121 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCAMP43121 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCAMP43121 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCAMP43121 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCAMP43121 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MCAMP43121 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCAMP43121 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCAMP43121 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCAMP43121 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCAMP43121 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCAMP43121 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCAMP43121 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCAMP43121 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCAMP43121 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MCAMP43121 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCAMP43121 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MCAMP43121 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCAMP43121 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCAMP43121 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCAMP43121 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCAMP43121 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCAMP43121 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCAMP43121 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCAMP43121 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCAMP43121 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCAMP43121 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCAMP43121 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCAMP43121 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCAMP43121 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCAMP43121 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCAMP43121 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCAMP43121 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCAMP43121 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCAMP43121 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCAMP43121 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCAMP43121 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCAMP43121 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCAMP43121 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MCAMP43121 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCAMP43121 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCAMP43121 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCAMP43121 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCAMP43121 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCAMP43121 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCAMP43121 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCAMP43121 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCAMP43121 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCAMP43121 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCAMP43121 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCAMP43121 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCAMP43121 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCAMP43121 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCAMP43121 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCAMP43121 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCAMP43121 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCAMP43121 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCAMP43121 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCAMP43121 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCAMP43121 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCAMP43121 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCAMP43121 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCAMP43121 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MCAMP43121 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCAMP43121 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms