Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CPS1P31327 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CPS1P31327 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CPS1P31327 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CPS1P31327 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CPS1P31327 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CPS1P31327 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CPS1P31327 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CPS1P31327 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CPS1P31327 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CPS1P31327 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CPS1P31327 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CPS1P31327 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CPS1P31327 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CPS1P31327 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CPS1P31327 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CPS1P31327 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CPS1P31327 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CPS1P31327 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CPS1P31327 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CPS1P31327 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CPS1P31327 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CPS1P31327 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CPS1P31327 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CPS1P31327 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CPS1P31327 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CPS1P31327 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CPS1P31327 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CPS1P31327 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CPS1P31327 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CPS1P31327 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CPS1P31327 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CPS1P31327 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CPS1P31327 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CPS1P31327 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CPS1P31327 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CPS1P31327 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CPS1P31327 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CPS1P31327 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CPS1P31327 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CPS1P31327 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CPS1P31327 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CPS1P31327 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CPS1P31327 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CPS1P31327 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CPS1P31327 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CPS1P31327 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CPS1P31327 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CPS1P31327 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CPS1P31327 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CPS1P31327 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CPS1P31327 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CPS1P31327 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CPS1P31327 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CPS1P31327 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CPS1P31327 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CPS1P31327 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CPS1P31327 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CPS1P31327 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CPS1P31327 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CPS1P31327 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CPS1P31327 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CPS1P31327 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CPS1P31327 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CPS1P31327 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CPS1P31327 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CPS1P31327 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CPS1P31327 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CPS1P31327 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CPS1P31327 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CPS1P31327 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CPS1P31327 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CPS1P31327 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CPS1P31327 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CPS1P31327 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CPS1P31327 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CPS1P31327 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CPS1P31327 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CPS1P31327 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CPS1P31327 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CPS1P31327 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CPS1P31327 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CPS1P31327 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CPS1P31327 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CPS1P31327 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CPS1P31327 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CPS1P31327 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CPS1P31327 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CPS1P31327 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CPS1P31327 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CPS1P31327 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CPS1P31327 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CPS1P31327 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CPS1P31327 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CPS1P31327 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CPS1P31327 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CPS1P31327 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CPS1P31327 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CPS1P31327 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CPS1P31327 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms