Protein–RNA interactions for Protein: P28907

CD38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD38P28907 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD38P28907 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD38P28907 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD38P28907 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD38P28907 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD38P28907 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD38P28907 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD38P28907 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD38P28907 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CD38P28907 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD38P28907 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD38P28907 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD38P28907 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD38P28907 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD38P28907 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD38P28907 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD38P28907 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD38P28907 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD38P28907 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD38P28907 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD38P28907 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD38P28907 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD38P28907 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD38P28907 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD38P28907 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD38P28907 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD38P28907 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD38P28907 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD38P28907 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD38P28907 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD38P28907 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD38P28907 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CD38P28907 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD38P28907 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD38P28907 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD38P28907 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD38P28907 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD38P28907 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD38P28907 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD38P28907 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD38P28907 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD38P28907 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD38P28907 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD38P28907 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD38P28907 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD38P28907 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD38P28907 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD38P28907 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD38P28907 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD38P28907 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD38P28907 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD38P28907 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD38P28907 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD38P28907 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD38P28907 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD38P28907 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD38P28907 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD38P28907 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD38P28907 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CD38P28907 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD38P28907 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD38P28907 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD38P28907 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD38P28907 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD38P28907 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD38P28907 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD38P28907 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD38P28907 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CD38P28907 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CD38P28907 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CD38P28907 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CD38P28907 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CD38P28907 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CD38P28907 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CD38P28907 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD38P28907 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD38P28907 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD38P28907 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD38P28907 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD38P28907 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD38P28907 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD38P28907 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD38P28907 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD38P28907 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD38P28907 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD38P28907 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD38P28907 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD38P28907 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD38P28907 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD38P28907 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD38P28907 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD38P28907 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD38P28907 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD38P28907 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD38P28907 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD38P28907 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CD38P28907 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CD38P28907 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CD38P28907 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD38P28907 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms