Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PEX2P28328 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PEX2P28328 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PEX2P28328 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PEX2P28328 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PEX2P28328 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PEX2P28328 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PEX2P28328 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PEX2P28328 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PEX2P28328 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PEX2P28328 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PEX2P28328 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PEX2P28328 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PEX2P28328 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX2P28328 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX2P28328 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX2P28328 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX2P28328 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX2P28328 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX2P28328 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX2P28328 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX2P28328 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX2P28328 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX2P28328 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX2P28328 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX2P28328 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX2P28328 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX2P28328 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX2P28328 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX2P28328 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX2P28328 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX2P28328 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX2P28328 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX2P28328 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX2P28328 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX2P28328 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX2P28328 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX2P28328 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX2P28328 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX2P28328 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX2P28328 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX2P28328 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX2P28328 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX2P28328 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX2P28328 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX2P28328 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX2P28328 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX2P28328 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX2P28328 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX2P28328 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PEX2P28328 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PEX2P28328 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PEX2P28328 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PEX2P28328 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PEX2P28328 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PEX2P28328 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PEX2P28328 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PEX2P28328 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PEX2P28328 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PEX2P28328 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PEX2P28328 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PEX2P28328 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PEX2P28328 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PEX2P28328 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PEX2P28328 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PEX2P28328 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PEX2P28328 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PEX2P28328 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PEX2P28328 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PEX2P28328 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PEX2P28328 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PEX2P28328 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PEX2P28328 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PEX2P28328 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PEX2P28328 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PEX2P28328 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PEX2P28328 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PEX2P28328 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PEX2P28328 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PEX2P28328 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PEX2P28328 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PEX2P28328 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PEX2P28328 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX2P28328 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX2P28328 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX2P28328 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX2P28328 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX2P28328 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX2P28328 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX2P28328 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX2P28328 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX2P28328 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX2P28328 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX2P28328 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX2P28328 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX2P28328 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX2P28328 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX2P28328 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX2P28328 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX2P28328 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms