Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SDSP20132 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDSP20132 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDSP20132 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDSP20132 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDSP20132 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDSP20132 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDSP20132 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDSP20132 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDSP20132 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDSP20132 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDSP20132 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDSP20132 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDSP20132 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDSP20132 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDSP20132 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDSP20132 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDSP20132 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDSP20132 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDSP20132 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDSP20132 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SDSP20132 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDSP20132 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SDSP20132 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDSP20132 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDSP20132 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDSP20132 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDSP20132 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDSP20132 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDSP20132 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDSP20132 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SDSP20132 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDSP20132 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDSP20132 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDSP20132 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDSP20132 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDSP20132 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDSP20132 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDSP20132 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDSP20132 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDSP20132 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDSP20132 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDSP20132 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SDSP20132 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDSP20132 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDSP20132 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDSP20132 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDSP20132 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDSP20132 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDSP20132 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SDSP20132 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDSP20132 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SDSP20132 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDSP20132 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDSP20132 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDSP20132 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDSP20132 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDSP20132 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDSP20132 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDSP20132 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDSP20132 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDSP20132 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDSP20132 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDSP20132 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDSP20132 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDSP20132 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDSP20132 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDSP20132 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDSP20132 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDSP20132 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDSP20132 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDSP20132 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDSP20132 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDSP20132 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDSP20132 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDSP20132 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SDSP20132 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDSP20132 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDSP20132 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDSP20132 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDSP20132 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDSP20132 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDSP20132 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDSP20132 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDSP20132 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDSP20132 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDSP20132 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDSP20132 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDSP20132 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SDSP20132 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDSP20132 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDSP20132 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SDSP20132 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDSP20132 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDSP20132 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDSP20132 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDSP20132 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDSP20132 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SDSP20132 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDSP20132 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms