Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms