Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
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