Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRPRAP08240 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRPRAP08240 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRPRAP08240 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRPRAP08240 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SRPRAP08240 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRPRAP08240 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRPRAP08240 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRPRAP08240 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRPRAP08240 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRPRAP08240 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRPRAP08240 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRPRAP08240 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRPRAP08240 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRPRAP08240 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRPRAP08240 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRPRAP08240 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRPRAP08240 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRPRAP08240 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRPRAP08240 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRPRAP08240 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRPRAP08240 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRPRAP08240 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRPRAP08240 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRPRAP08240 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRPRAP08240 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRPRAP08240 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRPRAP08240 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRPRAP08240 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRPRAP08240 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRPRAP08240 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRPRAP08240 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRPRAP08240 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRPRAP08240 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRPRAP08240 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRPRAP08240 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRPRAP08240 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRPRAP08240 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRPRAP08240 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRPRAP08240 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRPRAP08240 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRPRAP08240 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRPRAP08240 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRPRAP08240 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRPRAP08240 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRPRAP08240 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRPRAP08240 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRPRAP08240 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRPRAP08240 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRPRAP08240 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRPRAP08240 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRPRAP08240 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRPRAP08240 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRPRAP08240 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRPRAP08240 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRPRAP08240 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRPRAP08240 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRPRAP08240 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRPRAP08240 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRPRAP08240 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SRPRAP08240 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SRPRAP08240 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SRPRAP08240 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRPRAP08240 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SRPRAP08240 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRPRAP08240 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRPRAP08240 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SRPRAP08240 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SRPRAP08240 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SRPRAP08240 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SRPRAP08240 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SRPRAP08240 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SRPRAP08240 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
SRPRAP08240 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SRPRAP08240 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SRPRAP08240 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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