Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJB1P08034 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJB1P08034 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJB1P08034 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJB1P08034 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJB1P08034 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJB1P08034 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJB1P08034 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
GJB1P08034 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJB1P08034 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJB1P08034 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJB1P08034 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJB1P08034 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
GJB1P08034 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJB1P08034 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJB1P08034 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJB1P08034 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJB1P08034 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJB1P08034 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJB1P08034 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJB1P08034 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJB1P08034 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB1P08034 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB1P08034 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB1P08034 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB1P08034 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB1P08034 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB1P08034 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB1P08034 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB1P08034 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB1P08034 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB1P08034 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB1P08034 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB1P08034 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB1P08034 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB1P08034 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB1P08034 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB1P08034 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB1P08034 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB1P08034 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB1P08034 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB1P08034 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB1P08034 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB1P08034 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB1P08034 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB1P08034 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB1P08034 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB1P08034 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB1P08034 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB1P08034 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB1P08034 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB1P08034 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB1P08034 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB1P08034 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB1P08034 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB1P08034 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB1P08034 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB1P08034 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB1P08034 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB1P08034 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB1P08034 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB1P08034 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB1P08034 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB1P08034 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB1P08034 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB1P08034 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB1P08034 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB1P08034 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB1P08034 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB1P08034 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB1P08034 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB1P08034 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB1P08034 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB1P08034 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB1P08034 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB1P08034 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB1P08034 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB1P08034 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB1P08034 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJB1P08034 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJB1P08034 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJB1P08034 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJB1P08034 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJB1P08034 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJB1P08034 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJB1P08034 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJB1P08034 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GJB1P08034 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GJB1P08034 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJB1P08034 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJB1P08034 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GJB1P08034 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJB1P08034 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJB1P08034 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GJB1P08034 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GJB1P08034 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJB1P08034 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJB1P08034 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJB1P08034 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJB1P08034 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms