Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CENPBP07199 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CENPBP07199 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CENPBP07199 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CENPBP07199 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CENPBP07199 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CENPBP07199 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CENPBP07199 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CENPBP07199 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CENPBP07199 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CENPBP07199 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CENPBP07199 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CENPBP07199 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CENPBP07199 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CENPBP07199 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CENPBP07199 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CENPBP07199 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CENPBP07199 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CENPBP07199 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CENPBP07199 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CENPBP07199 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CENPBP07199 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CENPBP07199 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CENPBP07199 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CENPBP07199 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CENPBP07199 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CENPBP07199 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CENPBP07199 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CENPBP07199 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CENPBP07199 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CENPBP07199 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CENPBP07199 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CENPBP07199 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CENPBP07199 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPBP07199 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPBP07199 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPBP07199 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPBP07199 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPBP07199 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPBP07199 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPBP07199 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPBP07199 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPBP07199 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPBP07199 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPBP07199 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPBP07199 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPBP07199 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPBP07199 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPBP07199 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPBP07199 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPBP07199 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPBP07199 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPBP07199 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPBP07199 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPBP07199 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPBP07199 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPBP07199 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPBP07199 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPBP07199 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPBP07199 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPBP07199 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPBP07199 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPBP07199 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPBP07199 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPBP07199 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPBP07199 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPBP07199 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPBP07199 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPBP07199 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPBP07199 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPBP07199 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPBP07199 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPBP07199 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPBP07199 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPBP07199 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPBP07199 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPBP07199 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPBP07199 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPBP07199 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPBP07199 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CENPBP07199 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CENPBP07199 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CENPBP07199 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CENPBP07199 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CENPBP07199 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CENPBP07199 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CENPBP07199 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CENPBP07199 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CENPBP07199 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CENPBP07199 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CENPBP07199 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CENPBP07199 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CENPBP07199 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CENPBP07199 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CENPBP07199 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CENPBP07199 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CENPBP07199 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CENPBP07199 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CENPBP07199 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CENPBP07199 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms