Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms