Protein–RNA interactions for Protein: O43255

SIAH2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH2O43255 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms