Protein–RNA interactions for Protein: O15194

CTDSPL, CTD small phosphatase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPLO15194 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CTDSPLO15194 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CTDSPLO15194 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CTDSPLO15194 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CTDSPLO15194 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CTDSPLO15194 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CTDSPLO15194 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CTDSPLO15194 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CTDSPLO15194 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CTDSPLO15194 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTDSPLO15194 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTDSPLO15194 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTDSPLO15194 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTDSPLO15194 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTDSPLO15194 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTDSPLO15194 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTDSPLO15194 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTDSPLO15194 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTDSPLO15194 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTDSPLO15194 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTDSPLO15194 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTDSPLO15194 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTDSPLO15194 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTDSPLO15194 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTDSPLO15194 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTDSPLO15194 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTDSPLO15194 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTDSPLO15194 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTDSPLO15194 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTDSPLO15194 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTDSPLO15194 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTDSPLO15194 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTDSPLO15194 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTDSPLO15194 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTDSPLO15194 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTDSPLO15194 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms