Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
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