Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN8O00124 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms