Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms