Protein–RNA interactions for Protein: C9J366

IQCJ-SCHIP1, IQCJ-SCHIP1 readthrough, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQCJ-SCHIP1C9J366 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms