Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ27

NEURL1B, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL1BA8MQ27 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEURL1BA8MQ27 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEURL1BA8MQ27 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEURL1BA8MQ27 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEURL1BA8MQ27 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEURL1BA8MQ27 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEURL1BA8MQ27 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEURL1BA8MQ27 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEURL1BA8MQ27 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEURL1BA8MQ27 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEURL1BA8MQ27 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEURL1BA8MQ27 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEURL1BA8MQ27 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEURL1BA8MQ27 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEURL1BA8MQ27 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NEURL1BA8MQ27 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEURL1BA8MQ27 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEURL1BA8MQ27 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEURL1BA8MQ27 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEURL1BA8MQ27 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEURL1BA8MQ27 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEURL1BA8MQ27 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEURL1BA8MQ27 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEURL1BA8MQ27 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEURL1BA8MQ27 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEURL1BA8MQ27 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEURL1BA8MQ27 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEURL1BA8MQ27 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEURL1BA8MQ27 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NEURL1BA8MQ27 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEURL1BA8MQ27 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEURL1BA8MQ27 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEURL1BA8MQ27 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEURL1BA8MQ27 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEURL1BA8MQ27 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEURL1BA8MQ27 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEURL1BA8MQ27 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEURL1BA8MQ27 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEURL1BA8MQ27 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEURL1BA8MQ27 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NEURL1BA8MQ27 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEURL1BA8MQ27 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEURL1BA8MQ27 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NEURL1BA8MQ27 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NEURL1BA8MQ27 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEURL1BA8MQ27 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEURL1BA8MQ27 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEURL1BA8MQ27 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEURL1BA8MQ27 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEURL1BA8MQ27 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEURL1BA8MQ27 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEURL1BA8MQ27 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEURL1BA8MQ27 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEURL1BA8MQ27 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEURL1BA8MQ27 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEURL1BA8MQ27 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEURL1BA8MQ27 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEURL1BA8MQ27 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEURL1BA8MQ27 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEURL1BA8MQ27 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEURL1BA8MQ27 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEURL1BA8MQ27 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEURL1BA8MQ27 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEURL1BA8MQ27 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEURL1BA8MQ27 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NEURL1BA8MQ27 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEURL1BA8MQ27 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEURL1BA8MQ27 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEURL1BA8MQ27 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEURL1BA8MQ27 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEURL1BA8MQ27 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEURL1BA8MQ27 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NEURL1BA8MQ27 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEURL1BA8MQ27 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEURL1BA8MQ27 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEURL1BA8MQ27 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEURL1BA8MQ27 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEURL1BA8MQ27 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEURL1BA8MQ27 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
NEURL1BA8MQ27 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
NEURL1BA8MQ27 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms