Protein–RNA interactions for Protein: A6NK06

ACOD1, Cis-aconitate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACOD1A6NK06 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACOD1A6NK06 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms