Protein–RNA interactions for Protein: A6NHT5

HMX3, Homeobox protein HMX3, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX3A6NHT5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms