Protein–RNA interactions for Protein: A4QMS7

C5orf49, Uncharacterized protein C5orf49, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf49A4QMS7 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms