Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC28■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC28■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms