Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B1

PRELID3B, PRELI domain containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3BQ9Y3B1 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms