Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms