Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms