Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms