Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms