Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
MBD5Q9P267 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MBD5Q9P267 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MBD5Q9P267 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
MBD5Q9P267 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
MBD5Q9P267 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
MBD5Q9P267 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
MBD5Q9P267 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
MBD5Q9P267 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC27.57■■■□□ 2
MBD5Q9P267 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
MBD5Q9P267 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MBD5Q9P267 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
MBD5Q9P267 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MBD5Q9P267 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
MBD5Q9P267 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MBD5Q9P267 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MBD5Q9P267 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
MBD5Q9P267 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
MBD5Q9P267 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
MBD5Q9P267 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MBD5Q9P267 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
MBD5Q9P267 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
MBD5Q9P267 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
MBD5Q9P267 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
MBD5Q9P267 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC27.57■■■□□ 2
MBD5Q9P267 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms