Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALCOCO1Q9P1Z2 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALCOCO1Q9P1Z2 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALCOCO1Q9P1Z2 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALCOCO1Q9P1Z2 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CALCOCO1Q9P1Z2 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CALCOCO1Q9P1Z2 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALCOCO1Q9P1Z2 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALCOCO1Q9P1Z2 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALCOCO1Q9P1Z2 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CALCOCO1Q9P1Z2 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALCOCO1Q9P1Z2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALCOCO1Q9P1Z2 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALCOCO1Q9P1Z2 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALCOCO1Q9P1Z2 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALCOCO1Q9P1Z2 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALCOCO1Q9P1Z2 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALCOCO1Q9P1Z2 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALCOCO1Q9P1Z2 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALCOCO1Q9P1Z2 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALCOCO1Q9P1Z2 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALCOCO1Q9P1Z2 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALCOCO1Q9P1Z2 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CALCOCO1Q9P1Z2 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CALCOCO1Q9P1Z2 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CALCOCO1Q9P1Z2 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CALCOCO1Q9P1Z2 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CALCOCO1Q9P1Z2 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms