Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 CASC19-229ENST00000641418 1373 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 IMMP2L-204ENST00000447215 1164 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 AC135178.5-201ENST00000602597 674 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 AL117339.1-201ENST00000419779 428 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 TCEANC-205ENST00000544987 1146 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 LINC01922-201ENST00000562582 719 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms