Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms