Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 AC096732.1-201ENST00000439565 477 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 AC234781.1-201ENST00000444722 459 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 AP005136.2-201ENST00000583253 1049 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 LINC01284-201ENST00000442994 730 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 TRAF3IP3-201ENST00000367023 1065 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 AC115285.1-201ENST00000424879 736 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 RAB28P2-201ENST00000454299 641 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 LINC00648-204ENST00000557749 443 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 AL133330.1-201ENST00000510619 704 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms