Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms