Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms