Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
KDM5DQ9BY66 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
KDM5DQ9BY66 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM5DQ9BY66 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms