Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms