Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SSBP4Q9BWG4 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SSBP4Q9BWG4 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SSBP4Q9BWG4 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SSBP4Q9BWG4 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SSBP4Q9BWG4 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SSBP4Q9BWG4 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SSBP4Q9BWG4 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SSBP4Q9BWG4 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SSBP4Q9BWG4 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SSBP4Q9BWG4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SSBP4Q9BWG4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SSBP4Q9BWG4 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP4Q9BWG4 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP4Q9BWG4 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP4Q9BWG4 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP4Q9BWG4 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP4Q9BWG4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP4Q9BWG4 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP4Q9BWG4 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP4Q9BWG4 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP4Q9BWG4 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP4Q9BWG4 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP4Q9BWG4 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP4Q9BWG4 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP4Q9BWG4 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP4Q9BWG4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP4Q9BWG4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP4Q9BWG4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP4Q9BWG4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP4Q9BWG4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP4Q9BWG4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP4Q9BWG4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP4Q9BWG4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP4Q9BWG4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP4Q9BWG4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP4Q9BWG4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP4Q9BWG4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP4Q9BWG4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP4Q9BWG4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP4Q9BWG4 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP4Q9BWG4 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP4Q9BWG4 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP4Q9BWG4 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP4Q9BWG4 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP4Q9BWG4 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP4Q9BWG4 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP4Q9BWG4 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP4Q9BWG4 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP4Q9BWG4 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP4Q9BWG4 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP4Q9BWG4 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP4Q9BWG4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP4Q9BWG4 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP4Q9BWG4 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP4Q9BWG4 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSBP4Q9BWG4 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSBP4Q9BWG4 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSBP4Q9BWG4 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms