Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWE0

REPIN1, Replication initiator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPIN1Q9BWE0 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 AL139317.3-201ENST00000555969 898 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 AL357833.2-202ENST00000413757 372 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms