Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms