Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms