Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms