Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX0

CMTM3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3Q96MX0 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms