Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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