Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms